Con la entrada en funcionamiento del Instituto Dominicano de Investigaciones Agropecuarias y Forestales (IDIAF), toda la investigación de los sectores agropecuario y forestal del país se han concentrado en esta novel entidad, que ha trillado con éxito sus primeros años de existencia. A tal efecto, CODOCAFE mantiene un convenio de cooperación interinstitucional con el IDIAF para la realización de las investigaciones en materia de café. Proyectos específicos de investigación y validación de tecnología son realizados en distintas zonas del país. Asimismo, CODOCAFE posee dos centros de Desarrollo Tecnológico, uno para la Región Norte ubicado en La Cumbre , Santiago, y otro para la Región Sur ubicado en La Lanza , Barahona.

Con el Proyecto de Mejoramiento de la Calidad del Café Dominicano y Promoción de los Cafés Especiales (PROCA´2), CODOCAFE ha iniciado varios proyectos de investigación sobre aspectos relevantes relacionados con la calidad del café, cuyos resultados estará a la disposición de la comunidad cafetalera próximamente.